Fundada em 26 de setembro de 1993, a Escola Básica 2/3 de São Silvestre constituiu-se como Agrupamento de Escolas de S. Silvestre em 2009 e dele faziam parte as escolas do 1.º ciclo (EB1) de Antuzede, Bairro Azul, S. João do Campo, S. Martinho de Árvore, S. Silvestre, Vera Cruz e Vila Verde. Faziam ainda parte os jardins-de-infância (JI) de Andorinha, Antuzede, Bairro Azul, S. João do Campo, S. Martinho de Árvore e Vila Verde.

No ano letivo de 2012/2013 passou a integrar o AECC, com o nome de Escola Básica N.º 2 de São Silvestre.